Llegar al Instituto de filosofía presupone la formación humana adquirida en el Menor y el encuentro fuerte con Cristo vivido en el Curso Introductorio. Este instituto buscará la integración entre lo humano en todas sus dimensiones y la personalidad cristiana del llamado al sacerdocio.

La filosofía es una de las alas del conocimiento, diría Juan Pablo II, donde el hombre desarrolla al máximo la luz de la razón natural –don de Dios- para comprender e iluminarse a sí mismo y al mundo. Sin embargo, este Instituto es mucho más que el estudio, es la vivencia de la experiencia de los apóstoles con el Buen Pastor.

El objetivo del Instituto de Filosofía es: Que el alumno integre su personalidad humana y cristiana y consolide su opción por el sacerdocio como estado de vida propia. Esto incluye la maduración en la fe, el conocerse y aceptarse a sí mismo, la madurez afectiva y el fortalecimiento de una conciencia crítica y constructiva, ante el hombre y ante el mundo.

A partir del verano del 2006 los estudios filosóficos del Seminario de Monterrey fueron admitidos ante la Secretaría de Educación Pública como la Universidad Sede de Sabiduría, por lo que el plan de estudios inicia en el Curso Introductorio.